Пробіотики - це препарати, що містять живі мікроорганізми, що підтримують правильну роботу травної та імунної систем. Вони добре працюють m.in в якості покриву під час антибіотикотерапії і підтримки в лікуванні синдрому роздратованого кишечника, інфекційної діареї або запору. В аптеках доступні веганські пробіотики, що містять штами бактерій, такі як Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus casei, Lactobacillus reuteri, Lactobacillus rhamnosus, Bifidobacterium breve, Bifidobacterium lactis і дріжджі Saccharomyces boulardii.